购买第二套房的契税应缴纳总价的3%。根据《契税法》第一条和第三条规定，无论个人还是家庭，只要不是唯一住房，都要按照契税法规定缴纳契税，税率为3%至5%。根据《契税法》第四条的计税依据规定，契税的计税依据是房屋总价。因此，购买第二套房的契税应缴纳总价的3%。
法律分析
国家规定购买第二套房、契税不享受优惠，无论个人还是家庭，只要不是唯一的住房，就要征收3%，所以二套房的契税应缴纳的税额为房屋总价的3%。
法律依据：
根据2021年9月1日起施行的《契税法》第一条
在中华人民共和国境内转移土地、房屋权属，承受的单位和个人为契税的纳税人，应当依照本法规定缴纳契税。
《契税法》第三条
契税税率为百分之三至百分之五。
《契税法》第四条
契税的计税依据：
（一）土地使用权出让、出售，房屋买卖，为土地、房屋权属转移合同确定的成交价格，包括应交付的货币以及实物、其他经济利益对应的价款；
（二）土地使用权互换、房屋互换，为所互换的土地使用权、房屋价格的差额；
（三）土地使用权赠与、房屋赠与以及其他没有价格的转移土地、房屋权属行为，为税务机关参照土地使用权出售、房屋买卖的市场价格依法核定的价格。
拓展延伸
购买小于90平米的第二套住房，契税应缴纳多少？
购买小于90平米的第二套住房时，根据我国相关法规，需要缴纳契税。契税是根据房屋的交易价格来计算的，具体缴纳金额为房屋交易价格的一定比例。根据目前的规定，契税的税率为1%至3%不等，具体税率根据房屋交易价格确定。因此，购买小于90平米的第二套住房时，您需要根据房屋的交易价格计算出应缴纳的契税金额。建议您咨询当地的税务部门或律师事务所，以获取准确的计算结果和缴税指导。请注意，税务可能随时变化，因此在购房前最好了解最新的规定。
结语
购买小于90平米的第二套住房时，根据我国相关法规，需要缴纳契税。契税是根据房屋的交易价格来计算的，具体缴纳金额为房屋交易价格的一定比例。根据目前的规定，契税的税率为1%至3%不等，具体税率根据房屋交易价格确定。建议您咨询当地的税务部门或律师事务所，以获取准确的计算结果和缴税指导。请注意，税务可能随时变化，因此在购房前最好了解最新的规定。
法律依据
中华人民共和国城市维护建设税法： 第三条 契税税率为百分之三至百分之五。
契税的具体适用税率，由省、自治区、直辖市在前款规定的税率幅度内提出，报同级人民代表大会常务委员会决定，并报全国人民代表大会常务委员会和备案。
省、自治区、直辖市可以依照前款规定的程序对不同主体、不同地区、不同类型的住房的权属转移确定差别税率。
中华人民共和国契税法： 第三条 契税税率为百分之三至百分之五。
契税的具体适用税率，由省、自治区、直辖市在前款规定的税率幅度内提出，报同级人民代表大会常务委员会决定，并报全国人民代表大会常务委员会和备案。
省、自治区、直辖市可以依照前款规定的程序对不同主体、不同地区、不同类型的住房的权属转移确定差别税率。
中华人民共和国城市维护建设税法： 第十条 纳税人应当在依法办理土地、房屋权属登记手续前申报缴纳契税。
