工程变更的程序：
1、首先提交工程变更申请报告；
2、填报变更原因、相关图纸和变更工程量和造价等；
3、承包商按工程变更通知令执行工程变更。
【法律依据】
《公路工程设计变更管理办法》第十四条
项目法人在报审设计变更文件时，应当提交以下材料：
（一）设计变更说明；
（二）设计变更的勘察设计图纸及原设计相应图纸；
（三）工程量、投资变化对照清单和分项概、预算文件。
第十五条
设计变更文件的审批应当在20日内完成。无正当理由，超过审批时间未对设计变更文件的审查予以答复的，视为同意。
需要专家评审的，所需时间不计算在上述期限内。审批机关应当将所需时间书面告知申请人。
